黃山市2018年兩起暴發(fā)疫情諾如病毒分子分型與基因特征分析
關(guān)鍵詞：諾如病毒 分子分型 進(jìn)化分析 暴發(fā)疫情
摘要：目的了解黃山市暴發(fā)疫情諾如病毒分子分型與基因特征。方法收集黃山市2018年兩起暴發(fā)疫情中具有胃腸炎癥狀患者的肛拭子標(biāo)本37份,采用實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Real-time PCR)對采集的標(biāo)本進(jìn)行諾如病毒核酸檢測,檢出的陽性標(biāo)本,采用逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增病毒衣殼區(qū)和聚合酶區(qū),并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行基因測序及分子分型鑒定,測序結(jié)果使用Mega 6.0軟件構(gòu)建進(jìn)化樹進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果 37份標(biāo)本中,16份標(biāo)本諾如病毒核酸陽性,其中11份測序成功,BLAST比對結(jié)果顯示11條序列均為諾如病毒GII.P16-GII.2基因型。兩起疫情中檢出的諾如病毒序列與福建泉州、江蘇泰州、南京和安徽宿州的毒株序列同源性較高。結(jié)論 GII.P16-GII.2基因型諾如病毒是引起黃山市黟縣兩起急性胃腸炎暴發(fā)疫情的主要病原體。
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