小鼠NFATc1相互作用蛋白功能及KEGG通路分析
關鍵詞：go富集分析 kegg信號通路 david
摘要：目的:利用生物信息學方法對小鼠NFATc1及相關蛋白功能進行預測與分析,為探討NFATc1生物學功能及作用機制提供借鑒。方法:利用在線數(shù)據(jù)庫STRING,選取系統(tǒng)打分高于0.800的20種蛋白質(zhì)與NFATc1構建蛋白相互作用網(wǎng)絡圖,并對該蛋白集合進行后續(xù)分析;采用DAVID在線分析工具對以上蛋白進行GO功能富集和KEGG信號通路分析。結果:GO富集分析顯示,該蛋白集合參與CaN/NFAT信號通路、轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、JUN蛋白磷酸化、基因表達正調(diào)控等生物學過程。具體分子功能主要是結合轉(zhuǎn)錄因子、鈣依賴蛋白絲氨酸/蘇氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心啟動子近端序列特異性結合DNA等;KEGG信號通路分析顯示,該蛋白集合主要富集于破骨細胞分化代謝、Wnt信號通路、T細胞受體信號通路、B細胞受體信號通路等。結論:NFATc1及其相關蛋白生物學功能具有廣泛性,其原因可能與參與多種細胞信號轉(zhuǎn)導通路相關。
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