白樺黃葉突變株Long non-coding RNA(LncRNA)測序及其靶基因
關(guān)鍵詞：白樺 黃葉突變株 lncrna 靶基因
摘要：葉色突變是植物最常見的突變性狀,其形成機(jī)理多樣。前期Cinnamoyl-coAReductase1(BpCCR1)基因的過表達(dá)白樺轉(zhuǎn)化株系中發(fā)現(xiàn)一個(gè)黃葉突變株系(yl),該株系全株葉片顏色在整個(gè)生長季均呈現(xiàn)黃色。試驗(yàn)以黃葉突變株yl、野生型白樺WT和轉(zhuǎn)BpCCR1基因OE11株系為材料,測定葉片光合色素含量,葉色參數(shù)和光合參數(shù),并采用轉(zhuǎn)錄組測序?qū)Σ町怢ncRNA及其靶基因進(jìn)行分析。結(jié)果表明:與對照株系(WT和OE11)相比,yl株系的葉綠素a、葉綠素b、總?cè)~綠素含量、類胡蘿卜素含量和凈光合速率降低,而yl株系的葉色參數(shù)的絕對值升高。此外,與WT相比,132個(gè)LncRNA在yl株系中差異表達(dá)。與WT相比,137個(gè)LncRNA在OE11株系中差異表達(dá)。與OE11相比,160個(gè)LncRNA在yl株系中差異表達(dá)。這些差異表達(dá)的LncRNA調(diào)控大量的靶基因并參與到卟啉和葉綠素生物代謝、類胡蘿卜素生物合成及光合作用等代謝通路。因此,這些差異LncRNA及其靶基因可能與黃葉突變株葉色變異的形成密切相關(guān)。
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