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玉米SPP基因家族的全基因組鑒定及表達(dá)分析
關(guān)鍵詞：mays 磷酸蔗糖磷酸酶 家族基因 生物信息學(xué) 表達(dá)譜
摘要：磷酸蔗糖磷酸酶(sucrose-phosphate phosphatase,SPP)是蔗糖生物合成途徑中的關(guān)鍵酶,其主要作用是將蔗糖-6-磷酸水解成蔗糖。本研究利用生物信息學(xué)手段從玉米基因組中鑒定了2個SPP家族基因,命名為ZmSPP1和ZmSPP2,并從系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系、蛋白結(jié)構(gòu)域、基因結(jié)構(gòu)和表達(dá)模式等方面分析了該基因家族的特征。結(jié)果發(fā)現(xiàn),ZmSPP基因在基因結(jié)構(gòu)上存在明顯差異,但其編碼蛋白的理化性質(zhì)高度相似,并且均含有S6PP結(jié)構(gòu)域和S6PP_C結(jié)構(gòu)域。表達(dá)譜分析顯示,ZmSPP在玉米各組織中均有表達(dá),但ZmSPP1的表達(dá)水平顯著高于ZmSPP2,這暗示ZmSPP1可能在玉米蔗糖-6-磷酸水解過程中扮演重要作用。進(jìn)一步分析授粉阻斷后的葉片RNA測序數(shù)據(jù),結(jié)果表明阻斷授粉可以抑制玉米葉片中ZmSPP1基因表達(dá),但不影響ZmSPP2基因表達(dá)。本研究將為進(jìn)一步解析玉米ZmSPP基因的功能提供重要依據(jù)。
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