轉錄組測序研究蘭州百合抗凍關鍵基因及途徑
關鍵詞：蘭州百合 低溫脅迫 轉錄組測序 差異基因 抗凍基因
摘要：【目的】百合(Lilium)是國家衛(wèi)生部首批公布的藥食同源植物,也是著名的觀賞植物。低溫凍害嚴重影響植物的產量和分布,探究蘭州百合對零下低溫脅迫應答的分子機制?！痉椒ā坎捎酶咄縄lluminaHiseq測序平臺對蘭州百合的20℃常溫對照與-4℃寒冷處理(D)進行測序,并對測序數(shù)據(jù)進行分析研究?！窘Y果】處理24h后檢測到24465個差異表達的基因,篩選后獲得4143個表達量上升的基因和4415個表達量下降的基因,占差異表達基因總數(shù)的10.27%?！窘Y論】經富集分析認為,與蛋白激酶、蛋白磷酸酶、碳代謝以及ABA等相關的基因可作為研究蘭州百合零下低溫響應機制的主要研究對象。qRT-PCR分析表明,隨機選出的10個差異性表達基因的表達趨勢與高通量測序結果相一致。此外,吲哚-3-甘油磷酸合成酶、蛋白磷酸酶、已糖激酶、鈣結合蛋白、葉綠素a/b結合蛋白等基因可作為與蘭州百合寒冷響應相關的應答候選基因,為揭示蘭州百合抗凍分子機制奠定了基礎。
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