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蓖麻WOX轉(zhuǎn)錄因子家族成員的全基因組分析及逆境脅迫響應(yīng)
關(guān)鍵詞：蓖麻 wox轉(zhuǎn)錄因子 生物信息學(xué)分析 逆境脅迫
摘要：WOX是植物中特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,參與植物發(fā)育和應(yīng)激反應(yīng)。為探究蓖麻基因組WOX轉(zhuǎn)錄因子信息,本研究通過生物信息學(xué)方法鑒定出11個(gè)蓖麻WOX轉(zhuǎn)錄因子家族成員,并對(duì)其系統(tǒng)發(fā)育、基因結(jié)構(gòu)、保守基序及理化性質(zhì)等基本信息進(jìn)行鑒定與分析。結(jié)果顯示,11個(gè)WOX成員被分為三個(gè)進(jìn)化支,在古代進(jìn)化支、中間進(jìn)化支和現(xiàn)在進(jìn)化支分別有2、2和7個(gè)成員,同一進(jìn)化支成員的外顯子、基因結(jié)構(gòu)具有相似性,但理化性質(zhì)差異較大。利用RT-qPCR檢測(cè)根、莖、葉不同組織中5個(gè)蓖麻RcWOXs基因在干旱與鹽脅迫下表達(dá)情況,結(jié)果表明,RcWOXs在不同組織中的表達(dá)具有特異性;除RcWOX10受干旱脅迫抑制外,RcWOX2、RcWOX4、RcWOX8和RcWOX9在干旱和鹽脅迫下均被誘導(dǎo)表達(dá),表明RcWOX轉(zhuǎn)錄因子在蓖麻逆境脅迫中起調(diào)控作用。本研究結(jié)果為進(jìn)一步探究蓖麻WOX轉(zhuǎn)錄因子家族在逆境脅迫中的功能提供了一定的理論參考。
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