蘿卜蚜有翅型和無(wú)翅型轉(zhuǎn)錄組差異分析
關(guān)鍵詞：蘿卜蚜 轉(zhuǎn)錄組 生物信息學(xué)分析 差異表達(dá)基因
摘要：采用Illumina測(cè)序平臺(tái)獲得了蘿卜蚜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),有翅蚜和無(wú)翅蚜混合樣本共得到107992806條CleaningReads,組裝得到69588條Unigene序列,平均長(zhǎng)度為716bp。有翅蚜測(cè)序結(jié)果共得到44620184條CleaningReads;無(wú)翅蘿卜蚜測(cè)序結(jié)果共得到47113716條CleaningReads。2組樣品差異表達(dá)基因的分析表明共有顯著性差異表達(dá)基因104個(gè),其中表達(dá)上調(diào)基因有74個(gè),表達(dá)下調(diào)基因有30個(gè)。對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO注釋及KEGG富集分析顯示,Hippo信號(hào)通路、甲狀腺激素信號(hào)通路和催產(chǎn)素信號(hào)通路與翅型分化及與之緊密聯(lián)系的生殖率差異相關(guān)性較強(qiáng)。
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