NCOA2促進急性B淋巴細胞白血病細胞增殖及下游信號通路的生物信息學分析
關鍵詞：急性b淋巴細胞白血病 ncoa2 細胞增殖 生物信息學
摘要：目的探討核受體輔激活因子2(Nuclear Receptor Coactivator2,NCOA2)在急性B淋巴細胞白血病(B-ALL)細胞增殖中的作用,并利用生物信息學方法探究NCOA2促進B-ALL細胞增殖涉及的基因和信號通路。方法在B-ALL細胞Nalm6及BALL-1中使用siRNA技術敲減NCOA2,通過Western blot檢測NCOA2的敲除效率,通過EdU方法檢測Nalm6及BALL-1細胞的增殖能力變化;使用GEO2R軟件分析NCOA2敲減細胞系的表達譜數(shù)據(jù)(GSE118992),找到有意義的差異基因;使用DAVID和KOBAS軟件對差異基因進行GO和KEGG分析,對差異基因的作用和參與的信號通路進行聚類分析;使用Venny2.1軟件對GO和KEGG中參與調(diào)控細胞增殖的因子進行并集分析;使用STRING軟件分析參與NCOA2調(diào)節(jié)細胞增殖相關基因之間的相互作用關系。結(jié)果NCOA2siRNA能夠抑制NCOA2蛋白表達和Nalm6及BALL-1細胞的增殖能力,同時篩選出受其調(diào)控的差異顯著性基因322個,選擇排在前十位的生物學功能和信號通路,把其中參與調(diào)節(jié)細胞增殖的基因取并集,找到受NCOA2調(diào)控的參與細胞增殖的4個基因(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),發(fā)現(xiàn)它們之間具有相關作用關系。結(jié)論NCOA2調(diào)節(jié)細胞增殖相關因子(TGFBR2、CRKL、CCND2、PDGFRA),參與B淋巴細胞白血病發(fā)生發(fā)展。
解剖科學進展雜志要求:
{1}來稿摘要從文章正文提煉，盡量使用原文字句，體現(xiàn)文章特色或重點。字數(shù)在200字左右為宜，關鍵詞3-5個。
{2}來稿需包括文章名、內(nèi)容提要、關鍵詞。內(nèi)容提要需能簡明扼要、客觀準確地體現(xiàn)出論文的主要觀點；關鍵詞要以分號分隔并列。
{3}本刊收到投稿后，會及時進行送審等工作，如逾3個月無回音，作者可自行處理，請勿一稿多投. 編輯部對錄用稿件有權(quán)作技術性和文字上的修改。
{4}文中小標題一般分為三級，第一級標題用“一、”、“二、”、“三、”標示;第二級標題用“1．”、“2．”、“3．”標示，第三級標題用“(1)”、“(2)”、“(3)”標示，每級標題序號前均空兩格。
{5}參考文獻必須以作者親自閱讀過的近年主要公開文獻為限，勿引內(nèi)部資料，盡量少引教科書。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
