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八肋游仆蟲(chóng)組織蛋白酶B基因家族的分子克隆及序列分析
關(guān)鍵詞：八肋游仆蟲(chóng) 組織蛋白酶b 序列分析
摘要：組織蛋白酶B (cathepsin B, CTSB)是一種主要存在于溶酶體中的半胱氨酸蛋白水解酶,廣泛存在于各種生物中。為了研究八肋游仆蟲(chóng)組織蛋白酶B (Euplotes octocarinatus Cathepsin B, EoCTSB)基因的序列、結(jié)構(gòu)和功能,本研究利用生物信息學(xué)方法,對(duì)八肋游仆蟲(chóng)組織蛋白酶B基因進(jìn)行了系統(tǒng)分析。利用相似性搜索及系統(tǒng)進(jìn)化分析,共鑒定得到6個(gè)EoCTSBs基因。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)及3′RACE分析結(jié)果表明這6個(gè)基因均具有轉(zhuǎn)錄活性。通過(guò)與其他真核生物的組織蛋白酶B比較,結(jié)果顯示,6種EoCTSBs均含有保守的肽鏈內(nèi)切酶催化活性位點(diǎn),但都缺失封閉環(huán)結(jié)構(gòu),因此推測(cè)它們都沒(méi)有外肽酶活性;僅EoCTSB-6的S2亞位為酸性氨基酸殘基,暗示其具有催化特異性底物Z-Arg-Arg-AMC水解的活性。本研究為后續(xù)深入探討EoCTSB的生物學(xué)功能提供理論依據(jù)。
基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志要求:
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