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      八肋游仆蟲組織蛋白酶B基因家族的分子克隆及序列分析

      劉婧妮; 宋建英; 王軟林; 梁愛華 山西大學生物技術研究所; 化學生物學與分子工程教育部重點實驗室; 太原030006

      關鍵詞:八肋游仆蟲 組織蛋白酶b 序列分析 

      摘要:組織蛋白酶B (cathepsin B, CTSB)是一種主要存在于溶酶體中的半胱氨酸蛋白水解酶,廣泛存在于各種生物中。為了研究八肋游仆蟲組織蛋白酶B (Euplotes octocarinatus Cathepsin B, EoCTSB)基因的序列、結構和功能,本研究利用生物信息學方法,對八肋游仆蟲組織蛋白酶B基因進行了系統(tǒng)分析。利用相似性搜索及系統(tǒng)進化分析,共鑒定得到6個EoCTSBs基因。轉錄組數(shù)據及3′RACE分析結果表明這6個基因均具有轉錄活性。通過與其他真核生物的組織蛋白酶B比較,結果顯示,6種EoCTSBs均含有保守的肽鏈內切酶催化活性位點,但都缺失封閉環(huán)結構,因此推測它們都沒有外肽酶活性;僅EoCTSB-6的S2亞位為酸性氨基酸殘基,暗示其具有催化特異性底物Z-Arg-Arg-AMC水解的活性。本研究為后續(xù)深入探討EoCTSB的生物學功能提供理論依據。

      基因組學與應用生物學雜志要求:

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      基因組學與應用生物學

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