利用BSA-seq發(fā)掘棉花適宜機(jī)采的果枝長(zhǎng)度相關(guān)QTL
關(guān)鍵詞：棉花 株型育種 果枝長(zhǎng)度 機(jī)采棉 qtl
摘要：【目的】將群體分離分析法與下一代測(cè)序技術(shù)相結(jié)合,定位與棉花果枝長(zhǎng)度關(guān)聯(lián)的數(shù)量性狀位點(diǎn)。【方法】以Ⅰ式果枝品系蘇機(jī)棉125和Ⅱ式果枝品種泗抗1號(hào)為親本,構(gòu)建棉花F2分離群體。根據(jù)F2群體單株中部果枝節(jié)間平均長(zhǎng)度,選擇極端性狀單株分為2組,構(gòu)建DNA混池。再對(duì)2個(gè)混池進(jìn)行重測(cè)序,分析2個(gè)混池之間的單核苷酸多態(tài)性和插入缺失突變,并利用歐式距離法關(guān)聯(lián)與果枝節(jié)間長(zhǎng)度相關(guān)的數(shù)量性狀位點(diǎn)。【結(jié)果】利用測(cè)序獲得的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)據(jù),在A3染色體上定位到1個(gè)與果枝節(jié)間長(zhǎng)度關(guān)聯(lián)的區(qū)域,區(qū)間范圍為0.8Mbp;利用測(cè)序獲得的缺失突變位點(diǎn)數(shù)據(jù),也在A3染色體上定位到1個(gè)關(guān)聯(lián)區(qū)域,區(qū)間范圍為1.09Mbp;2個(gè)關(guān)聯(lián)區(qū)域互相重合,重合區(qū)間為0.77Mbp。【結(jié)論】本研究中Ⅰ式果枝相關(guān)基因被定位在A3染色體上,說明棉花Ⅰ式果枝和〇式果枝的差異是因?yàn)檫z傳位點(diǎn)和模式的不同,而不是同一基因的劑量效應(yīng)。
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