阿司匹林抗人乳腺癌增殖的直接作用蛋白靶點的生物信息學(xué)分析
關(guān)鍵詞：阿司匹林 人乳腺癌 生物信息學(xué) 細胞周期 細胞分裂
摘要：目的基于生物信息學(xué)分析大量公共數(shù)據(jù)庫,探討阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的分子機制。方法利用Drug Bank 5.1.3搜索確定阿司匹林的直接靶點蛋白(DPTs),STRING在線構(gòu)建阿司匹林DPTs的蛋白-蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)和信號通路;使用cBio Portal研究人乳腺癌中DPTs基因突變,并利用OncoPrint可視化;從TCGA數(shù)據(jù)庫下載乳腺癌與正常組織中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用DECenter分析差異過表達基因,對STRING分析得到的DPTs相互關(guān)聯(lián)基因與TCGA中的差異過表達基因求交集,確認阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,并利用Gene Ontology進行GO功能富集分析。最終通過蛋白免疫印跡實驗驗證阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點。結(jié)果搜索Drug Bank 5.1.3確定了11個阿司匹林DPTs,KEGG通路富集表明其中6個DPTs(EDNRA,IKBKB,NFKB2,NFKBIA,PTGS2和TP53)與癌癥發(fā)生發(fā)展有關(guān)。通過分析TCGA數(shù)據(jù)庫中乳腺癌與正常組織中的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)獲得10220個過表達差異基因,與STRING分析得到的6個阿司匹林DPTs的相互關(guān)聯(lián)基因求交集,發(fā)現(xiàn)4個基因(CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1)可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,其基因功能主要富集于細胞周期與細胞分裂。蛋白免疫印跡實驗結(jié)果顯示:阿司匹林可以降低人乳腺癌細胞中CDC25C,TPX2,CDC20,PLK1的蛋白表達。結(jié)論CDC25C,TPX2,CDC20和PLK1可能是阿司匹林抑制人乳腺癌細胞增殖的潛在靶點,其可能通過影響細胞周期和細胞分裂發(fā)揮抗腫瘤增殖作用。
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