秋水仙堿誘導(dǎo)杉木胚珠基因的表達(dá)變化
關(guān)鍵詞：秋水仙堿 杉木 胚珠 轉(zhuǎn)錄組 基因表達(dá)
摘要：杉木(Cunninghamia lanceolata)具有胚珠裸露的特點(diǎn),為秋水仙堿快速進(jìn)入胚珠內(nèi)部從而提高誘導(dǎo)效率提供了有利條件。為研究秋水仙堿對(duì)胚珠的誘導(dǎo)效果,本研究采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分析杉木胚珠在秋水仙堿處理后的基因表達(dá)變化,并利用qRT-PCR技術(shù)對(duì)相關(guān)基因進(jìn)行表達(dá)驗(yàn)證。結(jié)果顯示,對(duì)于秋水仙堿處理組和對(duì)照組,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分別獲得6.39和6.96 Gb原始數(shù)據(jù),從頭組裝共獲得60 790條unigenes;兩組間共篩選出1 430個(gè)差異表達(dá)基因,從中獲得紡錘體形成相關(guān)基因4個(gè),DNA復(fù)制相關(guān)基因8個(gè),調(diào)控細(xì)胞周期相關(guān)基因6個(gè),都呈現(xiàn)顯著下調(diào)表達(dá)。qRT-PCR分析表明,NEDD1 (neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated gene 1)、MCM3 (minichromosome maintenance complex component 3)、MCM7、CDC6 (cell division cycle 6)和ATXR6 (trithorax-related protein 6)基因在秋水仙堿處理前后的表達(dá)趨勢(shì)與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果一致。本研究將秋水仙堿直接作用于胚珠并篩選得到差異表達(dá)基因,為深入研究秋水仙堿誘導(dǎo)多倍體的分子機(jī)理提供了基礎(chǔ)資料。
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