松材線蟲(chóng)Bx-ubc-3基因克隆及泛素通路鑒定
關(guān)鍵詞：松材線蟲(chóng) 泛素結(jié)合酶3 e2 泛素途徑
摘要：泛素途徑可以調(diào)節(jié)許多關(guān)鍵的細(xì)胞功能。為探究松材線蟲(chóng)中是否存在泛素途徑以及泛素途徑中的關(guān)鍵酶基因—泛素結(jié)合酶基因ubc3,構(gòu)建松材線蟲(chóng)cDNA文庫(kù),并進(jìn)行測(cè)序、ORF分析、同源性分析、系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)構(gòu)建、蛋白相互作用預(yù)測(cè)和分子動(dòng)力學(xué)模擬等工作?？寺〉介L(zhǎng)度為957bp的Bx-ubc-3基因片段。隨后的序列分析表明,其開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)度為738bp,編碼245個(gè)氨基酸;氨基6酸同源性分析結(jié)果表明,Bx-UBC-3與已知的泛素結(jié)合酶高度同源;蛋白互作和分子對(duì)接分析及分子動(dòng)力學(xué)模擬結(jié)果表明,Bx-UBC-3的結(jié)合位點(diǎn)位于一個(gè)α螺旋、一個(gè)Loop1(L1)環(huán)與一個(gè)Loop2(L2)環(huán);形成硫酯的Cys103位于L2上,構(gòu)成催化裂隙;Bx-UBC-3和Bx-Rbx1之間以及Bx-UBC-3和Bx-泛素之間形成氫鍵。這些結(jié)果表明松材線蟲(chóng)中存在一條理論泛素通路,其中的關(guān)鍵酶Bx-UBC-3是開(kāi)發(fā)高效抗線蟲(chóng)生物藥劑的潛在靶標(biāo)。
森林工程雜志要求:
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