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利用高分化種內(nèi)和種間序列構建單倍型中介網(wǎng)絡
康斌 程詩萌 閆靜靜 彭金彪 章樹業(yè) 上海市公共衛(wèi)生臨床中心 上海201508 復旦大學生物醫(yī)學研究院 上海200032
關鍵詞：單倍型網(wǎng)絡 中介網(wǎng)絡 群體遺傳 祖先序列 il37
摘要：單倍型網(wǎng)絡是用于分析和顯示單倍型序列進化關系的常用方法。中介網(wǎng)絡法常用于構建單倍型網(wǎng)絡，但該方法在利用序列差異較大的數(shù)據(jù)構建單倍型網(wǎng)絡時，會因長支問題導致算法可靠性下降。作者利用人．大猩猩祖先序列及人群IL37基因序列重建了代表人類共同祖先的中介序列。再將該序列與高分化人群DNA序列及外群序列一起構建單倍型中介網(wǎng)絡，有效解決了長支問題，提高了構建單倍型中介網(wǎng)絡的可靠性，為解決同類問題提供了一種簡便有效的參考方法。
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