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      基于遺傳算法酵母核小體定位性質(zhì)預(yù)測

      郭亞茹; 豐繼華; 于華崢; 牟錦; 黃月月; 劉珂 云南民族大學(xué)電氣信息工程學(xué)院; 昆明650504

      關(guān)鍵詞:核小體定位 酵母 分布模型 遺傳算法 

      摘要:在DNA序列上,定位模糊的特殊核小體與定位良好的普通核小體同時存在于染色體區(qū)域內(nèi),但由于二者的化學(xué)性質(zhì)差異不明顯,區(qū)分較為困難。本文針對實驗核小體在真核基因轉(zhuǎn)錄起始位點周圍的分布規(guī)律和保守性建立了一個核小體分布模型,并在前人所做的預(yù)測核小體位置的工作基礎(chǔ)上,利用遺傳算法尋找模型上不同性質(zhì)核小體的分布中心,構(gòu)建核小體定位性質(zhì)判別準(zhǔn)則,最終確定了轉(zhuǎn)錄起始位點上、下游定位良好和模糊核小體的位置。

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