乙型肝炎病毒S蛋白的序列特征分析
李滾; 張濤; 楊鑫榮; 盧香香 西安工業(yè)大學電子信息工程學院生物醫(yī)學工程系; 西安710021
關鍵詞：hbv病毒 s蛋白 抗原表位 生物信息學
摘要：乙肝病毒S蛋白是病毒的包膜蛋白,與病毒進入細胞有關,它存在逆轉錄過程并且具有極強的潛伏性。本論文應用生物信息學分析乙肝病毒S蛋白的序列特征,利用在線分析軟件預測乙肝病毒S蛋白的理化性質和親疏水性、跨膜區(qū)域、信號肽特征、磷酸化位點、二級結構以及乙肝病毒S蛋白的最佳抗原表位形成位置等。結果顯示了乙肝病毒S蛋白由226個氨基酸組成,理論等電點是8.21,為不穩(wěn)定蛋白,總平均親水性為0.649,是疏水蛋白質,并且該蛋白存在信號肽,有4個跨膜區(qū),有30個潛在的磷酸化位點,主要二級結構為α螺旋和無規(guī)則卷曲,同時,結合乙型肝炎病毒S蛋白的序列可及性、線性表位、β轉角、柔性、抗原性的預測結果,可以找到潛在的抗原表位區(qū)域,為乙型肝炎的表位疫苗研制提供重要的參考依據(jù),有利于進一步對乙型肝炎S蛋白的抗原性進行研究。
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