結(jié)腸癌中核內(nèi)miRNA的激活調(diào)控作用研究
關(guān)鍵詞：結(jié)腸癌 核內(nèi)mirna
摘要：為了探究增強子介導的核內(nèi)miRNA在結(jié)腸癌發(fā)生中的作用,本研究篩選了結(jié)腸癌中的差異表達的miRNA數(shù)據(jù)、結(jié)腸的特異性增強子數(shù)據(jù)、結(jié)腸癌中差異表達基因數(shù)據(jù),利用細胞核內(nèi)miRNA靶向增強子預測算法,篩選miRNA調(diào)控的結(jié)腸特異性增強子;利用增強子靶基因預測數(shù)據(jù),篩選核內(nèi)miRNA調(diào)控的差異表達靶基因,并且構(gòu)建核內(nèi)miRNA-靶基因網(wǎng)絡,并通過網(wǎng)絡的分析和篩選獲得結(jié)腸癌中關(guān)鍵的致病基因,同時對網(wǎng)絡中的靶基因進行GO的功能注釋。結(jié)果表明,我們所構(gòu)建的核內(nèi)miRNA-激活調(diào)控靶基因網(wǎng)絡包含miRNA-靶基因關(guān)系對2121個,259個節(jié)點,其中包含34個下調(diào)基因、183個上調(diào)的基因,7個下調(diào)的miRNA,35個上調(diào)的miRNA。而后我們分析了網(wǎng)絡進行的節(jié)點度的整體分布情況,發(fā)現(xiàn)網(wǎng)絡中大部分的節(jié)點的度都是小于10的,僅有少量miRNA結(jié)合和部分的差異表達基因節(jié)點的度大于10。核內(nèi)miRNA主要通過激活調(diào)控了一些應激反應相關(guān)的功能和,同時,抑制調(diào)控了細胞周期、細胞凋亡、細胞死亡巨噬細胞代謝等相關(guān)功能,通過激活和抑制相關(guān)功能誘發(fā)結(jié)腸癌的發(fā)生。從核內(nèi)miRNA的激活調(diào)控角度研究結(jié)腸癌的發(fā)病機制,是對原有細胞漿中miRNA抑制調(diào)控機制的補充,也為結(jié)腸癌的系統(tǒng)研究提供了新的視野。
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