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環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境中的細(xì)菌多樣性
關(guān)鍵詞：環(huán)高原湖泊環(huán)境 細(xì)菌 純培養(yǎng)法 高通量測(cè)序
摘要：采用純培養(yǎng)方法,選用6種培養(yǎng)基對(duì)23份環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境土壤樣品中的細(xì)菌進(jìn)行分離培養(yǎng),經(jīng)初步形態(tài)排重后共獲得83株細(xì)菌純培養(yǎng)物。菌株的16S rRNA基因序列信息顯示,這些菌株歸屬于3門12目15科19屬,優(yōu)勢(shì)細(xì)菌類群為鏈霉菌屬(Streptomyces)、芽胞桿菌屬(Bacillus)、短芽胞桿菌屬(Brevibacillus)和北里孢菌屬(Kitasatospora)。同時(shí)采用高通量測(cè)序分析的方法評(píng)估了這些土壤樣品中的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)特征。環(huán)境樣品中16S rRNA基因的V3~V4區(qū)序列分析顯示,從土壤樣品中檢測(cè)到分屬于17門36目74科130屬的細(xì)菌,涵蓋喀斯特高礦物質(zhì)環(huán)境、鹽堿湖泊環(huán)境、森林土壤環(huán)境中存在的優(yōu)勢(shì)菌群,其中變桿菌屬(Variibacter)、慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)以及嗜酸棲熱菌屬(Acidothermus)為優(yōu)勢(shì)屬,體現(xiàn)出該生境中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的獨(dú)特性。綜合純培養(yǎng)和高通量測(cè)序分析結(jié)果,環(huán)貴州喀斯特高原湖泊環(huán)境樣品中細(xì)菌群落特征和環(huán)境之間存在著明顯相關(guān)性,其中蘊(yùn)含著豐富的細(xì)菌資源,值得進(jìn)一步挖掘。
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