中國大陸地區(qū)H9亞型禽流感病毒時空進化分析
關(guān)鍵詞：h9亞型禽流感 中國大陸地區(qū) 進化分析
摘要：目的從分子水平研究中國大陸地區(qū)H9亞型禽流感病毒的起源、進化和地理擴散情況,為禽流感的防控提供科學(xué)依據(jù)。方法從全球公共流感病毒數(shù)據(jù)庫收集中國大陸地區(qū)的H9亞型禽流感病毒HA基因序列,通過對下載的序列進行比對和聚類篩選,得到1997—2018年180株含有準確采樣信息的序列,使用BEAST等生物信息學(xué)軟件分析病毒選擇壓力、構(gòu)建貝葉斯法時間進化樹以及重建病毒進化時空動態(tài)。結(jié)果序列的核苷酸差異在0.2%~20.7%之間,氨基酸的差異在0.0%~15.8%之間。編碼區(qū)的核苷酸替代率分別為:0.540、0.607和1.853。非同義突變率與同義突變率的比值的平均值為0.1789,但是在7個位點上比值大于1。HA基因的平均進化替代率為2.476×10^-3替換/位點/年,最早的公共祖先出現(xiàn)在1947.457年。構(gòu)建的基因進化樹的拓撲結(jié)構(gòu)分為多個分支,根節(jié)點最有可能的位置是廣東省,后驗概率為21.7%?；谀壳皵?shù)據(jù)的時空動態(tài)分析顯示,1959—2018年間病毒從廣東傳播到安徽,再到廣西、江蘇,再以江蘇為中心向周邊多個省份傳播,最后在多個省份之間出現(xiàn)傳播。其中江蘇傳出的6條路徑具有統(tǒng)計學(xué)支持。結(jié)論H9亞型禽流感病毒出現(xiàn)的時間可能比國內(nèi)最早報導(dǎo)的早很多,在中國多個省份之間傳播擴散情況復(fù)雜,江蘇省是傳播擴散的一個重要中心。
實用預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志要求:
{1}非直接引文注釋，注釋前應(yīng)加“參見”；非引用原始資料時，應(yīng)先注明原始作品之相關(guān)信息，再以“轉(zhuǎn)引自”為引領(lǐng)詞注明轉(zhuǎn)引之文獻詳細信息。
{2}本刊倡導(dǎo)嚴謹、求實的學(xué)風(fēng)，歡迎有真知灼見、有理有據(jù)、論證嚴密、合乎語法規(guī)范的學(xué)術(shù)論文。
{3}文中圖要有圖名，圖、表、文字切忌相互重復(fù)。文中數(shù)據(jù)一律采用法定計量單位。
{4}注釋：主要用于對文章篇名、作者及文內(nèi)某一專題內(nèi)容作必要的解釋或說明。序號在注釋處右上角用阿拉伯數(shù)字①②等表示。
{5}正文中的數(shù)據(jù)組不能同時采用圖、表、文字描述，可選用其一，選擇次序為：首先用圖、次之用表、最后用文字。
注：因版權(quán)方要求，不能公開全文，如需全文，請咨詢雜志社
