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關(guān)鍵詞：全基因組 線粒體基因組 有參考序列拼裝方法 從頭拼裝方法 拼裝軟件 

摘要：隨著測(cè)序技術(shù)的不斷發(fā)展,越來(lái)越多物種的全基因組數(shù)據(jù)被測(cè)定和廣泛應(yīng)用。在二代基因組數(shù)據(jù)爆發(fā)式增長(zhǎng)的同時(shí),除了核基因組數(shù)據(jù),線粒體基因組數(shù)據(jù)也非常重要。高通量測(cè)序的全基因組序列中除了核基因組序列也包括線粒體基因組序列,如何從海量的全基因組數(shù)據(jù)中提取和拼裝線粒體基因組序列并加以應(yīng)用成為線粒體基因組在分子生物學(xué)、遺傳學(xué)和醫(yī)學(xué)等方面的研究方向之一?；诖?從全基因組數(shù)據(jù)中提取線粒體基因組序列的策略及相關(guān)的軟件不斷發(fā)展。根據(jù)從全基因組數(shù)據(jù)中錨定線粒體reads的方式和后續(xù)拼裝策略的不同,可以分為有參考序列拼裝方法和從頭拼裝方法,不同拼裝策略及軟件也表現(xiàn)出各自的優(yōu)勢(shì)和局限性。本文總結(jié)并比較了當(dāng)前從全基因組數(shù)據(jù)中獲得線粒體基因組數(shù)據(jù)的策略和軟件應(yīng)用,并對(duì)使用者在使用不同策略和相關(guān)軟件方面給予建議,以期為線粒體基因組在生命科學(xué)的相關(guān)研究中提供方法上的參考。

遺傳雜志要求:

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{4}基金項(xiàng)目：獲得基金資助產(chǎn)出的文章應(yīng)注明基金項(xiàng)目名稱(chēng)，并在括號(hào)內(nèi)注明其項(xiàng)目編號(hào)。

{5}關(guān)鍵詞是反映論文主題概念的詞或詞組，為了便于檢索，一般應(yīng)選取稿件中的關(guān)鍵性詞組，數(shù)量要適中，3~8個(gè)。

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