2013-2018年新鄉(xiāng)市甲型H1N1流感病毒流行特征和基因進(jìn)化分析
關(guān)鍵詞：甲型h1n1流感病毒 流行特征 ha基因 na基因 序列比對
摘要：目的分析新鄉(xiāng)市2013年1月至2018年3月甲型H1N1流感病毒的流行和基因進(jìn)化特征,了解新鄉(xiāng)市甲型H1N1流感病毒的變異情況。方法采用描述性統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對新鄉(xiāng)市甲型H1N1流感病毒核酸陽性結(jié)果進(jìn)行分析;隨機(jī)抽取不同時(shí)間分離的20株病毒進(jìn)行血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)基因測序,使用DNAman軟件進(jìn)行核苷酸和氨基酸序列比對,采用鄰接法(neighbor-joining method,NJ)法進(jìn)行進(jìn)化樹分析。結(jié)果 2013-2017年新鄉(xiāng)市甲型H1N1流感呈低流行態(tài)勢,2018年初成為優(yōu)勢流行株,主要感染0~15歲人群(123/150,82.0%)。新鄉(xiāng)市分離株與同期疫苗株HA基因核苷酸和氨基酸同源性分別為96.65%~98.47%和96.64%~99.29%,NA基因核苷酸和氨基酸同源性分別為97.56%~99.22%和96.59%~99.19%。新鄉(xiāng)流行株HA基因分屬2個(gè)進(jìn)化分支;2013-2017年初的流行株與同期疫苗株相比出現(xiàn)多處變異,其中2016-2017年初的毒株同時(shí)出現(xiàn)抗原位點(diǎn)Sa區(qū)S162N、K163Q、Sb區(qū)S185T和Ca區(qū)S203T變異。NA基因進(jìn)化樹與HA結(jié)果對應(yīng),2013-2017年初的流行株NA基因有16處氨基酸突變;95%的毒株糖基化位點(diǎn)有8個(gè),分別是第42、50、58、63、68、88、146和235位。結(jié)論 2013-2018年新鄉(xiāng)市傳播的甲型H1N1流感病毒株發(fā)生了一定程度的變異,2017-2018年國際推薦的新的疫苗株更適用于當(dāng)前流行株,但仍需加強(qiáng)監(jiān)測。
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