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      中國(guó)地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA差異表達(dá)譜建立及應(yīng)用

      王曉堂; 肖蘭飛; 高繼萍; 梁宇翔; 軒瑞晶; 閆曉如; 高莉; 宋國(guó)華 山西醫(yī)科大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心; 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與人類疾病動(dòng)物模型山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 太原030001

      關(guān)鍵詞:中國(guó)地鼠 口腔鱗狀細(xì)胞癌 長(zhǎng)鏈非編碼rna 

      摘要:目的 篩選中國(guó)地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌組織樣本中具有差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,LncRNA),預(yù)測(cè)其靶基因,探究靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號(hào)通路。方法 采用二甲基苯并蒽涂抹法建立中國(guó)地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌模型,高通量測(cè)序技術(shù)構(gòu)建LncRNA差異表達(dá)譜,生物信息學(xué)技術(shù)篩選差異表達(dá)的LncRNA并進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),GO與KEGG富集分析分別預(yù)測(cè)靶基因的生物學(xué)功能及富集的信號(hào)通路。結(jié)果 與正常組織樣本相比,口腔鱗狀細(xì)胞癌組織樣本中篩選出54個(gè)顯著差異表達(dá)LncRNA(31個(gè)上調(diào),23個(gè)下調(diào))。功能性分析表明:與口腔癌相關(guān)的GO條目73條;KEGG富集的信號(hào)通路25條。結(jié)論 中國(guó)地鼠口腔鱗狀細(xì)胞癌樣本中差異表達(dá)的LncRNA可能通過(guò)靶向調(diào)控其靶基因參與調(diào)控多種生物學(xué)功能及口腔癌相關(guān)的信號(hào)通路,在口腔鱗狀細(xì)胞癌形成過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。

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