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電子克隆獲取甜菜富亮氨酸類受體蛋白激酶基因BvLRR-RPK2;1完整編碼區(qū)
關(guān)鍵詞：甜菜 基因克隆 電子克隆 完整編碼區(qū)
摘要：針對前期獲得的甜菜分子標(biāo)記位點(diǎn)進(jìn)行分析,以獲得甜菜中該位點(diǎn)相關(guān)的基因。結(jié)合電子克隆與常規(guī)克隆,獲取并驗(yàn)證目的基因片段,最后預(yù)測基因產(chǎn)物結(jié)構(gòu)與功能。結(jié)果獲得了一段長3467bp的片段,其中包含一個(gè)長3141bp的完整編碼區(qū),編碼一個(gè)長1046aa的富亮氨酸類受體蛋白激酶。將基因命名為BvLRR-RPK2;1。基因編碼區(qū)在基因組中連續(xù)存在,無內(nèi)含子區(qū)域。基因翻譯產(chǎn)物BvLRR-RPK2;1具有一個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,具有LRR-RPK家族的特征性結(jié)構(gòu)域,與已知的LRR-RPK/RLK類蛋白序列相似性在85%以下,與甜菜本身的預(yù)測序列在編碼區(qū)內(nèi)部有5個(gè)堿基、2個(gè)氨基酸的差異。本文獲得了一個(gè)甜菜中未經(jīng)克隆的LRR-RPK2編碼區(qū),并預(yù)測了其產(chǎn)物功能。
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